API Reference

• nstm package
  • Subpackages
    • nstm.commands package
  • Submodules
  • nstm.datasets module
    • Datasets
    • SIM3DDataLoader
    • SIM3DDataLoaderMultitime
    • image_resizing()
    • image_upsampling()
  • nstm.diffcam_flow module
    • DiffuserCamRSFlow
    • DiffuserCanRS
    • gen_loss_l2()
    • gen_loss_l2_row()
    • gen_nonneg_reg()
  • nstm.diffcam_main module
    • main()
  • nstm.diffcam_utils module
    • define_flags()
    • gen_indicator()
    • load_data_psf()
  • nstm.dpc_flow module
    • DPC
    • DPCFlow
    • gen_l2_reg_absorp()
    • gen_l2_reg_phase()
    • gen_loss_l2()
  • nstm.dpc_utils module
    • dpc_tikhonov_solver()
    • genMeasurmentsLinear()
    • genSourceAngular()
    • gen_transfer_func()
    • load_illum_pattern()
    • sourceGen()
  • nstm.hash_encoding module
    • AnnealedHashEmbedding
    • HashEmbedding
    • HashEmbeddingTime
    • HashEmbeddingTimeCombined
    • HashParameters
    • bilinear_interp()
    • get_pixel_vertices()
    • hash_fn()
    • linear_interp()
    • precision_to_dtype()
    • quadrilinear_interp()
    • trilinear_interp()
  • nstm.pos_encoding module
    • AnnealedPosenc
    • PosencParameters
  • nstm.sim3d_flow module
    • FluoSIM3D
    • FluoSIM3DWrapper
    • SIM3DSpacetime
    • gen_loss_l2()
    • gen_loss_l2_stack()
    • gen_loss_nonneg_reg()
  • nstm.sim3d_main module
    • define_model()
    • define_training_params()
    • main()
  • nstm.sim3d_utils module
    • SIMParameter3D
    • define_flags()
    • estimate_mod_illum()
    • gen_dampen_order0_mask()
    • generate_exp()
    • generate_sinusoidal()
    • get_modamp()
    • get_otf()
    • make_overlaps()
    • otf_support_mask()
    • rad_avg_OTF_expansion()
    • separate_bands()
  • nstm.spacetime module
    • MLP
    • MLPParameters
    • SpaceTimeMLP
    • SpaceTimeParameters
    • generate_dense_yx_coords()
    • generate_dense_zyx_coords()
    • get_trajectory()
  • nstm.utils module
    • OTF_3D_fluo()
    • PhantomTemporal
    • SystemParameters
    • SystemParameters3D
    • apodization()
    • apodize_edge()
    • brownian()
    • generate_affine_motion()
    • generate_linear_motion()
    • generate_rod_phantom()
    • hotpixel_removal()
    • load_video()
    • notch_filter()
    • object_transform()
    • object_transform_affine()
    • object_transform_swirl()
    • psf_gaussian_approx()
    • update_flags()
  • nstm.viz_utils module
    • add_inset()
    • add_scalebar()
    • color_coded_projection()
    • volume()
    • volume4d()
  • Module contents